Neprekidno poboljšavanje poslovanja na svim tržištima na kojima Podravka posluje dokazano je i certifikacijskim auditom (tijekom siječnja 2005. g.) tvornice Vegete, tvornice juha i polugotovih jela te pratećih organizacijskih cjelina prema IFS i BRC standardima. Podravka je jedna od prvih kompanija u Hrvatskoj koja posjeduje ove certifikate. IFS (International Food Standard) i BRC (British Retail Consortium) su maloprodajni standardi koji postaju uvjeti za pregovaranje kod velikih međunarodnih lanaca, a uključuju elemente sustava sigurnosti hrane, sustava upravljanja kvalitetom i preduvjete za proizvodnju zdravstveno ispravnih i sigurnih proizvoda. Također, Tvornici Studenac Lipik dodijeljen je Certifikat NSF za sva pakovanja vode marke Studena, a Tvornicama Danica i Koktel peciva dodijeljen je Halal certifikat 2007. godine. Sustav sigurnosti namirnica, temeljen na HACCP principima, također je razvijen i implementiran u svim spomenutim područjima i Ital-Iceu, Danici d.o.o. te Podravka Polska u Kostrzynu. HACCP je interno verificiran i pod redovitim je inspekcijskim nadzorom.